IncRNA PCR

長(zhǎng)鏈非編碼RNA (long non-coding RNA，IncRNA) 是一類(lèi)長(zhǎng)度在200nt以上，不編碼蛋白的RNA分子。研究發(fā)現(xiàn)，lncRNA具有保守的二級(jí)結(jié)構(gòu)，可以與蛋白、DNA 和RNA相互作用，參與了X染色體沉默、基因組印跡、染色質(zhì)修飾、轉(zhuǎn)錄激活或抑制、轉(zhuǎn)錄干擾、核內(nèi)運(yùn)輸?shù)榷喾N生物學(xué)過(guò)程的調(diào)控，與各種疾病的發(fā)生發(fā)展密切相關(guān)，成為近年來(lái)非編碼RNA和表觀遺傳研究的熱點(diǎn)和重點(diǎn)。

附錄.如何開(kāi)展lnc RNA研究？

01 差異lnc RNA篩選

去核糖體RNA法富集lncRNA進(jìn)行鏈特異建庫(kù)測(cè)序

基因編輯:
CRISPR-Cas9 crRNA
文庫(kù)

02 生物信息分析

Inc RNA表達(dá)差異分析

新IncRNA預(yù)測(cè)

IncRNA-mRNA 共表達(dá)分析

IncRNA功能預(yù)測(cè)

03 體外實(shí)驗(yàn)功能驗(yàn)證

功能獲得性研究：過(guò)表達(dá)載體

功能缺失性研究：siRNA,Smart Silencer,ASO

IncRNA檢測(cè)：qPCR,FISH

IncRNA功能驗(yàn)證RNA pull-down,CLIP-seq,ChIRP-seq,RIP-seq等

基因編輯：
CRISPR-Cas9系列及配套產(chǎn)品

04 體內(nèi)實(shí)驗(yàn)功能驗(yàn)證

構(gòu)建動(dòng)物模型

導(dǎo)入過(guò)表達(dá)載體、siRNA或ASO

檢測(cè)動(dòng)物表型變化，生化指標(biāo)和相關(guān)基因表達(dá)

可檢測(cè)樣本類(lèi)型

里來(lái)結(jié)合在lncRNA研究領(lǐng)域多年的經(jīng)驗(yàn)，根據(jù)提取方式、建庫(kù)難度和類(lèi)型不同，可提供多種lncRNA測(cè)序服務(wù)：

組織、細(xì)胞lncRNA測(cè)序

外泌體（Exosomes）lncRNA測(cè)序

常規(guī)檢測(cè)流程

qRT-PCR技術(shù)以其高靈敏度及高準(zhǔn)確性，已成為RNA表達(dá)豐度檢測(cè)的一個(gè)重要標(biāo)準(zhǔn)，二代測(cè)序及芯片數(shù)據(jù)往往都需要qRT-PCR檢測(cè)進(jìn)行驗(yàn)證，常規(guī)實(shí)驗(yàn)中的相對(duì)定量檢測(cè)或絕對(duì)定量檢測(cè)，qRT-PCR也是最合適的方法。
目前數(shù)據(jù)庫(kù)對(duì)lncRNA序列的收錄及注釋都不完備，大部分lncRNA的表達(dá)豐度也比較低，對(duì)lncRNA引物設(shè)計(jì)策略及qRT-PCR檢測(cè)提出了一定的挑戰(zhàn)。
lnkRNA需使用專(zhuān)用引物與專(zhuān)用試劑盒，詳情請(qǐng)咨詢。